Yep! Nicht unkompliziert....aber gut das alles zu wissen und im Hinterkopf zu haben. Der EITMS Schaltpunkt 2. Zyl. hinten ON/OFF ist übrigens bei 165°C (287°F). Der Sensor ist am hinteren Kopf in Fahrtrichtung rechts oben montiert. Mit Stage I (gesamt 3.500 km, ab 1.050 km OEM) griff das bei meiner RKS deutlich weniger ein, als noch in OEM (bis 1.050 km) und jetzt mit Stage II (> 6.000 km ab 4.500 km) noch viel seltener und nur noch im Hochsommer bei Hitze im Stau, oder lange LL Phasen rote Ampel in Städten bei Hitze. Das funktioniert und der 2. Zyl. überhitzt nicht. Meine Drehzahl ist in Stage II min. 840 - 920 max., je nach Temp. und steigt bei abgeschaltetem hintern Zylinder, als 1 - Zyl. dann auf 950 - 1.000 U/min. und schaltet den hinteren Zyl. ZU und AB, je nach Temp. Wenn die Lufttemp. etwas kühler ist, greift das System bei mir jetzt nicht mehr ein. Hab's ab Stunde 0 noch nie deaktiviert. Insgesamt, nach 10.600 km, bin ich jetzt allmählich sehr zufrieden mit dem M8 114 und der gnzen RKS, aber es war ein weiter Weg dort hin und auf meine alten Tage noch recht lehrreich.....

Generell gilt:
Zylinder 1 (vorne) ist immer etwas kühler, da er im Fahrtwind ist.
Zylinder 2 (hinten) wird demnach wärmer, weil er im "warmen" Wind sitzt. 

Deswegen werden Zündkerzen und Auspuff weißer. 
Und deswegen, sitzt dort auch der Temperaturfühler - somit regelt er eher, wenn es dort schon heiß ist. 

Du schreibst, dass die Kist abgestimmt wurde - evtl. liegt dort der Fehler. 
Generell sind die Mopeds recht mager abgestimmt, damit die Abgaswerte passen - darum  lassen sie sich auch so einfach tunen. 
Entweder Falschluft, oder dein Mapping passt einfach nicht, bzw ist von den Werten so, dass man immer noch TüV bekommt. 
Wenn die Kerzen vorne und hinten gleich aussehen, dann passt die Abstimmung auf jeden fall, dann würde ich nur über den Hubraum anfetten. 
Wenn  die sehr unterschiedlich aussehen, dann neu abstimmen. 

Das Kunststoffmanifold ist eine Sache, die irgendwann (Alter oder Leistungssteigerung) zum scheitern verurteilt ist. 
Das kann 2Jahre dauern, oder halt 25 und 100Tkm. 
Das macht sicher dann eher durch gefühlte Fehlzündungen (puffen oder stottern ) bemerkbar.

So sehen die Kerzen jedenfalls nicht aus. 
Mir wären die zu hell - das originale Kerzenbild, wenn am Moped nix geändert wurde, sieht aber auch so aus.
Ich würde das deinem Tuner mal mitteilen und gucken was der sagt. 

Ansonsten anschmeißen, Manifold absprühen und gucken ob Falschluft gezogen wird. 
Soll auch gut funktionieren, wenn jemand so´n Qualmpfeife hat - e pfluppe

Nein, der 1. Zylinder vorne, hinter dem Vorderrad, läuft immer kühler als der 2. Zylinder hinter dem ersten. Das ist der physikalisch bedingten Luftkühlung dieses Motors gezollt. Wenn andere etwas anderes behaupten, dann haben Sie die Zylinder anders beschrieben, aber das Gleiche gemeint. Ich will jetzt hier keinen durcheinander bringen, deswegen lasse ich mal die Zylindernummerierung nach DIN ISO 1204 hier raus. Da beginnt die Zylindernummerierung vom Abtriebsflansch aus gesehen. Beim V Motor die linke Zylinderbank A1;A2......und rechts B1,B2 usw. nach vorne zur freien Seite = die mit den Riemenscheiben etc. Bei Harley ist der erste Zylinder vorne und wie gesagt die Zündfolge 315 - 405° V-Twin. Zylinder 1 = 315° vorne und Zylinder 2 = 405° hinten. Zündfolge 1 - 2.

Vielleicht die Aussage, dass der hintere Zylinder kühler laufen muss, kann bedeuten: man fügt dem mehr Kraftstoff hinzu, damit dieser zusätzlich kühlt.  

Wenn mir jemand sagt, dass der hintere Zylinder Kühler laufen soll, dann würde ich das so interpretieren.

Das war keine Mär, sondern galt bis Ende Shovel MJ84 wegen seiner Gusseisernen Zylinder.