würde sie dem  auf den Hof stellen, wirst doch noch Garantie haben.
Ich hatte anfangs ähnliches (aber halt dauernd, nicht temperaturabhängig), was beim Mapping dann ausgemerzt wurde.

Luffi und NW waren damals bei mir schon verbaut..

Hast du die 2 Jahre Anschlussgarantie nicht? Alles was so motorseitig auftritt ,sollte da doch mit abgedeckt sein.

Da können wir aus der Ferne nur mutmaßen Daher wirst du um einen Besuch beim Händler nicht drum rum kommen und da du ja Garantie hast, ist das doch auch kein Problem. Dort kann man dir sagen, was es ist und ob es normal ist. 
Wir können hier nur vermuten, da wir das genaue Ruckeln ja nicht kennen....kommt es vom Motor, rutscht die Kupplung, … ? …..es gibt diverser Möglichkeiten. Um es einzugrenzen fehlt es an mehr Informationen.

Ist das Ruckeln vom untertourigen beschleunigen heraus?

Aus der Ferne was zu sagen, ist immer schwierig. Noch dazu. weil du und zu geänderter Hardware/Software keine Angaben gemacht hast.  
Hast du denn schon mal den Fehlerspeicher ausgelesen? Damit würde ich erst mal anfangen. Komisch, dass das dein Schrauber nicht als erstes gemacht hat. 

Dieses Ruckeln in bestimmten Drehzahlbereichen hat auf jeden Fall etwas mit der Aufbereitung des Zündgemisch zu tun. Da gibt es ja nicht so viele Baustellen, die in Frage kommen & gleichzeitig thermische Ursachen hat. Von so ganz weit weg, wie ich bin, tippe ich auf einen Sensor, der ein Problem hat. Gibt es da nicht diesen Sensor hinter dem 2. Zylinder, der gerne mal Ärger macht? 

Möglicherweise meint Ole den Temperatursensor für den hinteren Zylinder. 
Der halt dafür sorgt, dass sich der Zylinder abschaltet wenn er zu warm ist.
Sollte aber vornehmlich nur im Stand passieren und sobald man etwas Gas gibt, zündet's wieder.

Wenn der Sensor spinnt, oder n Kabelbruch etc. vorhanden ist, könnte das was sein.
Oder der TMAP Sensor in der Ansaugbrücke, undicht, locker, Kabelbruch, kaputt etc..
An der Stelle is ja irgendwann recht warm, und wenn die Luft von außen auch recht warm ist, vielleicht macht dann der TMAP murks und gibt was Blödsinniges ans Steuergerät.
Wenn man den Luftfilter abbaut, kommt man an den Sensor dran. Kannst gucken, ob was erkennbar ist.

Ist in der Tat schwierig einzugrenzen, zumal das ja nicht so einfach reproduzierbar ist und nur sporadisch auftritt.

TMAP Ole, TMAP (Temperature Manifold Absolute Pressure)

Ich würd, wie schon erwähnt, auch erstmal in diese Richtung gehen.
Meine mich auch entsinnen zu können, dass die TAMP's durchaus öfter mal rum zicken können.
Nicht speziell bei den M8er Motoren, eher generell. Sind ja auch nur billige Großserienteile von Bosch die überall verbaut werden.

Hab auch nicht vor da was zu machen: meine Eingangsfrage war, ob das auch schon jemand hatte, oder ob ich wirklich ein Einzelfall bin
Den Rest wird wohl mein Händler machen